| 順位 | チーム名 | 勝点 | 試合数 | 勝 | 分 | 負 | 得点 | 失点 | 得失点 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 高知ユナイテッドSC | 48 | 22 | 15 | 3 | 4 | 31 | 13 | 18 |
| 2 | 栃木シティFC | 44 | 22 | 13 | 5 | 4 | 43 | 27 | 16 |
| 3 | レイラック滋賀 | 38 | 23 | 11 | 5 | 7 | 35 | 19 | 16 |
| 4 | Honda FC | 36 | 23 | 10 | 6 | 7 | 29 | 21 | 8 |
| 5 | ヴェルスパ大分 | 36 | 23 | 9 | 9 | 5 | 30 | 30 | 0 |
| 6 | ヴィアティン三重 | 34 | 22 | 9 | 7 | 6 | 27 | 25 | 2 |
| 7 | ラインメール青森 | 33 | 22 | 8 | 9 | 5 | 25 | 18 | 7 |
| 8 | 沖縄SV | 33 | 22 | 9 | 6 | 7 | 39 | 33 | 6 |
| 9 | ブリオベッカ浦安 | 30 | 22 | 9 | 3 | 10 | 30 | 28 | 2 |
| 10 | アトレチコ鈴鹿クラブ | 29 | 22 | 8 | 5 | 9 | 30 | 28 | 2 |
| 11 | FCティアモ枚方 | 29 | 22 | 8 | 5 | 9 | 33 | 36 | -3 |
| 12 | ソニー仙台FC | 23 | 22 | 6 | 5 | 11 | 24 | 31 | -7 |
| 13 | FCマルヤス岡崎 | 23 | 23 | 5 | 8 | 10 | 24 | 32 | -8 |
| 14 | 横河武蔵野FC | 19 | 23 | 4 | 7 | 12 | 21 | 39 | -18 |
| 15 | クリアソン新宿 | 18 | 23 | 3 | 9 | 11 | 15 | 37 | -22 |
| 16 | ミネベアミツミFC | 16 | 22 | 4 | 4 | 14 | 19 | 38 | -19 |